从头建模

产品简介

不依赖已知的蛋白质结构，仅依据既定的物理定律，如量子力学、能量最小化、自由能计算等物理学知识，从目标蛋白质的氨基酸一级序列生成目标蛋白质的 3D 结构。该方法以氨基酸的原子坐标为变量，在设计的能量函数指导下进行构象搜索，产生众多可能的构象，选择能量最低的构象作为预测结果。

应用领域

生物学研究

蛋白质结构与功能关系研究：从头建模为解析蛋白质结构与功能的关系提供了重要手段。生物进化研究：比较不同物种中同源蛋白质的从头建模结构，分析其结构差异和保守区域，有助于揭示蛋白质的进化历程和物种间的亲缘关系。
蛋白质工程

酶的改造：对天然酶进行从头建模，了解其结构与功能关系，在此基础上对酶的活性中心或其他关键区域进行定点突变，改善酶的催化活性、稳定性或底物特异性。
蛋白质功能优化：根据从头建模的结果，设计全新的蛋白质结构，赋予其特定的功能。
药物设计与研发

靶点发现与验证：通过从头建模预测蛋白质结构，有助于发现新的药物作用靶点。
药物分子设计：基于从头建模得到的蛋白质三维结构，设计能够与之特异性结合的小分子药物。