蛋白质-小分子

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蛋白质-小分子

产品简介

揭示蛋白质与小分子之间的结合模式、结合位点以及相互作用力，帮助理解生物过程的分子机制，例如药物作用靶点的识别、酶与底物的相互作用等。

基于结构的药物设计，通过模拟来优化小分子药物的结构，提高其与目标蛋白质的亲和力和特异性，为新药研发提供理论指导。

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应用领域

药物研发
酶学研究
信号传导研究
结构生物学

药物研发

药物设计：通过模拟蛋白质与小分子的相互作用，明确药物作用靶点，基于靶点结构设计出能与之特异性结合的小分子药物。如针对肿瘤相关蛋白靶点，设计出具有高亲和力的小分子抑制剂，阻碍肿瘤细胞的增殖信号传导。
虚拟筛选：借助模拟技术，在海量的化合物库中快速筛选出可能与目标蛋白质有活性结合的小分子，大幅减少实验筛选的工作量和成本。
优化药物性质：对初步筛选出的药物分子进行结构优化，通过模拟预测其与蛋白质结合的稳定性、成药性等，提高药物的疗效和安全性。
酶学研究

催化机制解析：模拟蛋白质（酶）与小分子（底物）的相互作用过程，揭示酶催化反应的具体机制，包括底物结合方式、催化位点的作用、反应中间体的形成等。
酶工程改造：基于模拟结果，对酶的活性中心或其他关键区域进行定点突变等改造，提高酶的催化效率、底物特异性或稳定性等性能。
信号传导研究

受体 - 配体相互作用：研究细胞表面受体蛋白与小分子配体的结合模式和动态变化，理解信号如何通过受体激活并在细胞内传递。
信号通路调控：明确小分子对蛋白质信号通路的调控机制，为开发针对特定信号通路的调节剂提供理论依据。
结构生物学

蛋白质结构预测：在已知蛋白质序列的情况下，通过模拟其与小分子的相互作用，辅助预测蛋白质的三维结构。
复合物结构解析：对于蛋白质 - 小分子复合物，模拟可以在实验数据的基础上，进一步优化和完善复合物的结构模型，更准确地确定小分子在蛋白质结构中的结合位置和取向，以及蛋白质在结合小分子后的构象变化。